Life Simulation

python
re-search
bioinformatics

(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #1

Am facut fork pe GitHub la urmatorul repository de la @Cosmin_Popescu, ce poti spune @Cosmin_Popescu despre simularea vietii.

Am putea adauga @iamntz categoria re-search.


(Cosmin Popescu) #2

In anul 4 am facut la facultate Bioinformatica. Este o disciplina care foloseste tehnicile si algoritmilor din stiinta calculatoarelor pt rezolvarea problemelor din medicina si biologie

Exemplu de problema:
Se obtine codul genetic al unui nou organism si se direste sa se vada cu ce cod genetic ar semana
Codul genetic este un sir de litere din alfabetul ACTG

Acele programe in Python sunt rezolvarea laboratoarelor.

@Cosmin_Popescu iti multumeste pt steluta de pe github


(Cosmin Popescu) #3

Poate un exemplu de simulare este Conway the Game of Life


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #4

Tabelul de mai jos indică nucleotidele (Adenină, Guanină, Citosină, Uracil și Timină)


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #5

Il stiu dar e prea simplu.


(Cosmin Popescu) #6

Codul genetic este asemanator cu un program de calculator. Cea mai mare parte este comentata


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #7

Classical Genetics Simulator

A web-based genetics lab, allowing students to apply lessons in Mendelian genetics to real-world scenarios
http://cgslab.com/


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #8

DNA Computing and Molecular Programming

http://www.dna-computing.org/


(Cosmin Popescu) #9

@adavidoaiei cate ceva de citit in timpul liber :smiley:


https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?PAGE_TYPE=BlastSearch&PROG_DEF=blastn&BLAST_PROG_DEF=blastn&BLAST_SPEC=GlobalAln&LINK_LOC=BlastHomeLink


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #10

Incerc s-a caut niste exemple de implementare a acestor algoritmi in JavaScript, daca mai faceti re-search puteti pune aici:

http://biojs.net/


(Cosmin Popescu) #11

tradu-l pe asta din python in js


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #12

http://www.unibuc.ro/prof/niculae_c_m/bioinfo/cuprins.htm


(Adavidoaiei Dumitru-Cornel) #13

M-a uitam dupa un DNA simulator in JavaScript, nu am gasit ce am dorit:

https://gatc.ca/